Voor de hogescholen beslist het college van algemeen directeurs tot het verlenen van subsidies. Het college is samengesteld uit de in functie zijnde algemeen directeurs van de gesubsidieerde hogescholen. Er zijn drie subcolleges; gesubsidieerde vrije hogescholen, gesubsidieerde officiële hogescholen en de Vlaamse Autonome hogescholen.

De voorzitter voor de periode 2011-2012 is Maria de Smet en de ondervoorzitter is Dirk Franco. Zij behoren tot een verschillend subcollege en hun mandaat duurt twee jaar.
De leidend ambtenaar en een ambtenaar van AGIOn die het secretariaat van het college waarneemt wonen van rechtswege en met raadgevende stem de vergadering van het college bij.

Dit college van algemeen directeurs van de hogescholen verdeelt jaarlijks per hogeschool de investeringsmiddelen, die in de begroting voorzien zijn. De 3 subcolleges dienen elk begrotingsjaar een voorstel in tot verdeling van de machtigingsbedragen.

Het college legt ook zelf de verdelingscriteria voor de budgetverdeling vast. De uitgewerkte criteria worden wel voorgelegd aan het Vlaams Parlement.

De verdelingscriteria zijn gebaseerd op het aantal opgenomen studiepunten onder diplomacontract zoals geregistreerd in de DTO telling en gewogen per financieringsgroep.